高通量scRNA-seq中条形码微珠的先进合成


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李真20年,中国南京

专业:生物;认知科学

摘要

随着人类基因组研究需求的增加,高通量、低成本的scRNA-seq平台的研究被进一步推向了前沿。单细胞RNA测序可以将结果缩小到单细胞突变,为进一步的生物信息学分析,特别是癌症诊断提供明确的细节,而不是传统的细胞测序平均多个细胞的结果。虽然之前的研究主要是链霉亲和素包被微球和纯溶胶基微球,但由于其优异的耐高温性和PCR稳定性,我们选择了羧基包被磁微球进行进一步的合成。基于连接的条形码合成虽然是目前最流行的合成方法,但在过去的几年里已经达到了瓶颈。为了获得更高的cDNA捕获效率,本研究尝试通过三轮分裂池合成,采用基于延伸的合成方法改进基于连接的合成。将荧光涂层的反补寡聚FAM应用于研究产品,进行进一步的质量检测。这种方法为我们提供了细胞差异的更高分辨率,并更好地理解单个细胞在其微环境中的功能。

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